Czy w przedstawionej sytuacji spółka powinna uiścić zaległą kwotę podatku wraz z odsetkami, a następnie wystąpić z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty?

W drodze decyzji pokontrolnej organ podatkowy określił wysokość zobowiązania podatkowego w CIT-8 za 2014 r., w miejsce zadeklarowanej straty podatkowej. Spółka wpłaciła na rachunek bankowy wynikającą z decyzji zaległość podatkową wraz z odsetkami. W związku z tym, że decyzja organu pierwszej instancji została dostarczona po około roku od wszczęcia postępowania, przy kalkulacji odsetek, podatnik uwzględnił okresy bez odsetkowe i w ślad za dokonaną wpłatą przekazał organowi podatkowemu pismo, w którym objaśnił sposób wyliczenia odsetek. Organ podatkowy nie przekazał swego stanowiska w tej sprawie i dopiero w momencie, gdy Spółka wystąpiła do urzędu skarbowego z wnioskiem o wydanie zaświadczenia o niezaleganiu w podatkach, pozyskała informację o istnieniu zaległości podatkowej. Po kilku dniach rozmów telefonicznych pełnomocnika z przedstawicielem organu podatkowego, Spółka uzyskała rekomendację, aby uiścić zaległą kwotę wraz z odsetkami budżetowymi, a następnie wystąpić z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty.

Czy w przedstawionej sytuacji Spółka powinna powołać się na art. 72 par. 2 pkt 1) Ordynacji podatkowej?