W jakim terminie podatnik może odzyskać zwrot nienależnie wpłaconej kwoty na poczet podatku dochodowego?

Podatnik prowadzi działalność gospodarczą. Rozlicza się podatkiem liniowym płaconym kwartalnie. Za pierwszy kwartał zapłacił podatek, niestety przy obliczaniu zaliczki za drugi kwartał nie odliczyła się zaliczka zapłacona za pierwszy kwartał, w związku z czym zapłacił o 5000 zł za dużo. Podatnik chciałby te pieniądze zainwestować w swoją działalność.

Czy w związku z tym wystąpić do urzędu skarbowego z wnioskiem o zwrot tej kwoty?

Jeśli tak to jak długo ewentualnie należy czekać na odpowiedź i w jakim terminie urząd skarbowy zwraca nadpłatę?

Czy taki zwrot może łączyć się z ewentualną kontrolą z urzędu skarbowego?