Kiedy spółka może stosować obniżenie podatku u źródła mając certyfikat rezydencji?

Spółka z.o.o będąca polskim podatnikiem mającym siedzibę na terenie Rzeczypospolitej Polskiej dokonuje wypłaty na rzecz podmiotu powiązanego mającego siedzibę w Niemczech, wypłaty dotyczą odsetek od pożyczki i opłatę za udostępnienie znaku towarowego.

Czy spółka może stosować obniżenie podatku u źródła mając certyfikat rezydencji czy powyższe usługi obejmuje przepis o pobraniu podatku od wypłat powyżej 2 mln zł? Czy polska spółka mogła zastosować obniżenie lub zwolnienie wynikające z umowy unikania podwójnego opodatkowania kiedy uzyskała certyfikat po dokonaniu płatności ale certyfikat obejmuje okres z dnia wypłaty? Czy powyższe przepisy obejmują polska spółkę opodatkowaną CIT estońskim?