Jakie konsekwencje w VAT ma niezłożenie w terminie VAT-26?

Zakupiliśmy auto do działalności gospodarczej, które nie spełnia warunków auta ciężarowego wynikających z przepisów ustawy o VAT, dlatego złożyliśmy VAT-26 do US, aby korzystać z możliwości odliczenia 100% VAT. Jednak VAT-26 został złożony po terminie 7 dni, teraz ustalam wartość początkową środka trwałego i nie mam pewności jak powinnam odliczyć VAT od faktur, które zwiększają jego wartość początkową. Pomijam oczywiście fakturę zakupu, bo tutaj odliczam 50% VAT, lecz nie do końca wiem w jakiej wysokości odliczyć VAT np. z faktury dotyczącej transportu, czy przeglądu, kosztów poniesionych przed rejestracją.