Jak zaksięgować pokrycie różnicy w cenie niektórych części przy naprawie samochodu z przyznanego odszkodowania?

Naprawialiśmy auto w ramach przyznanego odszkodowania z ubezpieczenia. Jest to samochód osobowy, jednak służący do poruszania się wyłącznie po terenie zamkniętym, nie jest i nie był używany do celów prywatnych. Warsztat będzie rozliczał się z ubezpieczalnią. My płacimy VAT od usług naprawy. Zostaliśmy poinformowani także, że musimy pokryć różnicę w cenie niektórych części i usług w związku z potrąceniami amortyzacyjnymi.

Jak księgować te potrącenia?