Jak rozliczać koszty usług wykonywanych na rzecz spółki przez jej wspólnika?

Spółka komandytowa posiada trzech wspólników: dwie osoby fizyczne (komandytariuszy) i osobę prawną (spółkę z o.o., komplementariusza posiadającego 5% udziałów). Komplementariusz świadczy, na podstawie umowy o współpracy dla spółki komandytowej, usługi wsparcia polegające m.in. na: doradztwie z zakresu działalności gospodarczej, wspieranie w zakresie logistyki i sprzedaży, serwis posprzedażowy i pogwarancyjny. Spółka z o.o. wystawia fakturę za te czynności dla spółki komandytowej.

Czy wartość tej faktury w 5%, stosownie do udziałów, będzie kosztem uzyskania przychodów dla spółki z o.o., jako wykonującego tą czynność i będącego jednocześnie wspólnikiem spółki komandytowej?

W połowie roku wprowadzono w umowie spółki komandytowej zapis "komplementariusz ma prawo do wynagrodzenia za prowadzenie spraw spółki. Wysokość wynagrodzenie określa uchwała wspólników. Wynagrodzenie może polegać także na zwiększeniu udziału komplementariusza w zysku spółki przeznaczonym do podziału, ponad to, co przypada na niego proporcjonalnie do wkładu wniesionego do spółki." Wcześniej żadnego zapisu w tym temacie w umowie spółki komandytowej nie było.

Czy taki zapis coś zmienia, czy przed wprowadzeniem zmian w umowie spółki komandytowej odnośnie wynagrodzenia, przypadający koszt tej faktury, 5% stosownie do udziałów, będzie kosztem uzyskania przychodów dla spółki z o.o.?