Jak prawidłowo wystawiać notę?

Spółka ma z kontrahentem umowę na świadczenie usługi produkcyjnej. Spółka dostarcza surowce. W grudniu była faktura za wyprodukowanie określonej serii. Po przyjęciu do magazynu okazało się że usługa została wadliwie wykonana. Z umowy wynika że kontrahent pokryje odszkodowanie w przypadku błędnego wykonania usługi.

Czy obciążenie kontrahenta notą powinno być na wartość usługi + surowce? Czy też tylko surowce a na usługę powinna być wystawiona faktura korygująca?