Jak prawidłowo rozliczyć na gruncie VAT zaliczkę wpłaconą na poczet usługi budowlanej?

Spółka wpłaciła w 2016 r. zaliczkę na poczet usługi budowlanej. Zaliczka będzie rozliczana częściowo z kolejnych faktur za wykonane usługi (usługa budowlana jest długoterminowa, rozliczenia są za okresy miesięczne). W lutym została wystawiona faktura za usługi budowlane wykonane w 1.2017 r. Faktura była na kwotę 100.000 zł, wcześniejsza zaliczka na 50.000 zł. Spółka skorygowała VAT naliczony z faktury zaliczkowej w deklaracji za 1.2017 r. (w dacie wykonania usługi). Natomiast odwrotne obciążenie od 100.000 zł wykazała w deklaracji za 2.2017 r., gdyż wtedy powstał obowiązek podatkowy (data wystawienia faktury). Spółka zorientowała się w 5.2017 r., iż wraz z korektą podatku naliczonego z zaliczki w deklaracji za 1.2017 r. miała również wykazać odwrotne obciążenie od kwoty 50.000 zł, a drugie 50.000 zł w 2.2017 r.

Czy dokonując teraz korekty za 1.2017 r. i 2.2017 r. spółka ma wykazać VAT naliczony i należny w deklaracji za 1.2017 r. od zaliczki 50.000 zł, które to 50.000 zł wykazała po stronie podatku należnego i naliczonego w deklaracji za 2.2017 r.?

Czy jednak VAT naliczony z tych 50.000 zł ma wykazać w bieżącej nie złożonej deklaracji, a należny w deklaracji za 1.2017 r.?