Jak powinien postąpić organ podatkowy mając wątpliwości, czy faktycznie nieruchomość nie była wykorzystywana do działalności gospodarczej?

Spółka Akcyjna - Komandytowa składała w latach 2018-2021 deklaracje na podatek od nieruchomości wykazując w nich do opodatkowania grunty i budynki jako związane z prowadzeniem działalności gospodarczej. Po wyroku Trybunału Konstytucyjnego z 24.02.2021 r. Spółka złożyła korekty tych deklaracji i wykazała że grunty i budynki nie są wykorzystywane do prowadzonej działalności gospodarczej i opodatkowała je stawkami pozostałymi. Do korekty deklaracji został dołączony wniosek o zwrot nadpłaty podatku.

Jak powinien postąpić organ podatkowy mając wątpliwości, czy faktycznie nieruchomość nie była w żaden sposób wykorzystywana do prowadzonej działalności gospodarczej? Czy zanim zostanie wszczęte postępowanie w sprawie określenia prawidłowej wysokości zobowiązania podatkowego można wcześniej wezwać podatnika do złożenia wyjaśnień i dokumentów np. przedstawienia ewidencji księgowej. ewidencji środków trwałych itd., na podstawie której możliwe będzie ustalenie, czy koszty utrzymania danej nieruchomość były zaliczane do kosztów prowadzonej działalności gospodarczej?