Jak opodatkować zwrot nieruchomości, która w przeszłości wniesiona była do spółki z o.o. aportem?

Podatniczka (osoba fizyczna) w 2000 r. wniosła do spółki z o.o. nieruchomość wartą 4.000.000 zł (wartość aportu w umowie spółki) w zamian za co dostała udziały o wartości nominalnej 2.000.000 zł. Nieruchomość kupiła w 1995 r. za 2.000.000 zł. W 2020 r. spółka z o.o. zostanie zlikwidowana. Podatniczce zostanie wypłacone 6.000.000 zł, w związku z likwidacją (środki otrzymane w związku z likwidacją dla celów PIT).

Jaki będzie dochód do opodatkowania jako zysk z osób prawnych?

Czy w kosztach ujmie wartość nominalną udziałów, wartość historyczną nieruchomości, czy też wartość aportu z umowy spółki?