Jak opodatkować sprzedaż budynku wykorzystywanego w spółce jawnej?

W 2000 r. osoba fizyczna (A, małżeństwo B, małżeństwo C) kupiły użytkowanie wieczyste gruntu z prawem własności posadowionych na nim budynków za kwotę X (z czego kwota Y to wartość budynków, kwota Z - wartość użytkowania wieczystego). Kupujący nabyli nieruchomość w udziale 1/3 każdy, z czego A do majątku osobistego, małżeństwa B i C do majątku wspólnego. Zakup tej nieruchomości nastąpił od prywatnych osób fizycznych nie podlegał VAT (została naliczona opłata skarbowa). Osoba A, jak i mężowie z małżeństwa B i C byli na moment zakupu nieruchomości (i nadal są) wspólnikami spółki jawnej (w równym udziale w zyskach; spółka powstała w latach 90). Po zakupie nieruchomości wspólnicy zdecydowali ująć ją w ewidencji środków trwałych (trudno powiedzieć na jakiej podstawie). Następnie spółka amortyzowała budynki (od kwoty Y), co zakończyła w 2010 r. (odpisy były zaliczone do kosztów uzyskania przychodów). Gruntu nie amortyzowano. W 2015 r. A, małżonkowie B i C zakupili prawo własności ww. gruntu (w udziałach 1/3 każdy) od Skarbu Państwa za kwotę V (wydatek ten nie został ujęty w kosztach spółki, przy zakupie nie został naliczony VAT). Od momentu nabycia nieruchomości (2000 r.) przez ww. osoby i ujęcia jej w ewidencji ŚT spółki, spółka wykorzystywała ją (i nadal wykorzystuje) na potrzeby prowadzonej przez nią działalności (wynajmowała/wynajmuje ją, wystawiając faktury wraz z VAT). Właściciele planują sprzedać tę nieruchomość, zawarto już warunkową umowę przedwstępną (warunki to m.in. uzyskanie przez sprzedających prawomocnej decyzji o warunkach zabudowy i zagospodarowania).

Czy, ewentualnie jak, sprzedający powinni opodatkować tę sprzedaż PIT, tj.: czy powstanie u nich przychód z działalności, który powinni opodatkować wspólnicy (poza żonami) podatkiem liniowym, proporcjonalnie do udziału w zyskach, czy też sprzedaż ta powinna być uznana za prywatną sprzedaż nieruchomości, niepodlegającą już PIT (upływ 5 lat)?

Jeśli sprzedaż powinna podlegać PIT, jakie będzie można zaliczyć koszty podatkowe (np. kwotę Z i V, czy też Y)?