Jak należy liczyć termin do wydania decyzji ustalającej zobowiązanie podatkowe w PDOF w zakresie nieujawnionych źródeł przychodu?

W wyniku przeprowadzenia postępowania kontrolnego wobec podatnika w zakresie nieujawnionych źródeł pochodzenia majątku, organ podatkowy ustalił kwotę nie znajdującą pokrycia w ujawnionych źródłach przychów w wysokości X. Ustalenie powyższe zawarto w decyzji Dyr. UKS z 11.2013 r., określając podatnikowi zryczałtowany pod. dochodowego od osób fiz. za 2007 r. w kwocie X. (skutecznie doręczony 11.2013 r.). Podatnik odwołał się od decyzji Dyr. UKS, wnosząc o jej uchylenie w całości i umorzenie postępowania w sprawie. Dyr IS po rozpatrz. odwołania, decyzji z 5.2014 r. utrzymał w mocy zaskarżoną decyzję organu I inst. Od ww. decyzji organu odwoławczego, wniesiono w 5.2014 r. skargę do WSA. Sąd ten wyrokiem z 1.2015 r. uchylił decyzję. Dyr. IS, wskazując na uchybienie w zakresie postępowania podatkowego mogące mieć wpływ na wynik sprawy. Po zebraniu dodatkowych materiałów dowodowych i po ponownym rozpatrz. sprawy, stosując się do wskazań zawartych w wyr. WSA, Dyr IS decyzją z 7.2016 r. uchylił w całości decyzję organu I inst. i ustalił podatnikowi zryczałtowany podatek dochodowy w kwocie niższej niż pierwotna. Również ta decyzja została zaskarżona do WSA pismem z 9.2016 r. Podatnik wniósł o uchylenie zaskarżonej decyzji w całości oraz o przekazanie sprawy do ponownego rozpoznania. Wyrokiem z 3.2017 r. WSA uchylił zaskarżoną decyzję (z 7.2016 r.). WSA wskazał, że w tym przypadku organ odwoławczy rozpoznawał sprawę już po 1.1.2016 r. i mimo wydanego w sprawie wyroku z 1.2015 r. powinien mieć na uwadze art. 3 ust. 1 ustawy z dnia 16.1.2015 r. o zmianie ust. o pod. dochodowym od os. fiz. oraz ust. ord. pod. Decyzją z dnia 9.10.2017 r. Dyr. IS uchylił decyzję organu I instancji w całości i wymierzył podatnikowi na rok 2007 zryczałtowany pod. dochodowy w kwocie Y.

Jak należy liczyć termin do wydania decyzji ustalającej zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób fiz. w zakresie nieujawnionych źródeł przychodu, w stanie faktycznie przedstawionym w pytaniu (w związku ze zmianą przepisów i uchyleniem art. 68 § 4 o.p.)?

Czy organ II instancji, który orzekał merytorycznie w sprawie w 2017 r. nie powinien mieć na uwadze już art. 68 § 4a o.p., przewidującego krótszy termin do wydania decyzji ustalającej?