Czy VAT z niemieckiego paragonu można ująć w kosztach?

Spółka z o.o. świadczy usługi budowlane na terenie kraju jak i poza terytorium kraju. W związku z delegacjami pracowników i usługami wykonywanymi na terenie UE, np w Niemczech pracownicy zakupują tam w marketach drobne narzędzia potrzebne do wykonania usług, np ładowarki akumulatorowe do narzędzi, śrubki, wałki, pędzle, wiadra, młotki, odzież roboczą itp. Są to towary które nie są przemieszczane z terytorium Państwa w którym zostały kupione ponieważ będą tam używane do wykonywania usług. Pracownicy zapominają o podaniu NIP nabywcy w związku z czym za zakup tych towarów otrzymują paragon nie zawierający NIP nabywcy co wiąże się z brakiem możliwości odzyskania kwoty VAT.

Czy koszty uzyskania przychodów powinny zostać ujęte w księgach w kwocie netto, a VAT naliczony przez sprzedawcę jako NKUP, czy może w kwocie brutto?