Czy spółka po podpisaniu aneksu może kwalifikować otrzymywane opłaty za zarządzanie jako niepodlegające VAT?

Spółka realizowała projekt w ramach POKL, Działaniu 6.2 Wsparcie oraz promocja przedsiębiorczości i samozatrudnienia, współfinansowanym ze środków EFS, zgodnie z zawartą umową o dofinansowanie z Wojewódzkim Urzędem Pracy (instytucją zarządzającą). Projekt polegał na udzielaniu pożyczek dla przedsiębiorców na preferencyjnych warunkach. Po zakończeniu realizacji projektu rozpoczął się okres monitowania, w trakcie którego spółka otrzymywała refundacje ponoszonych kosztów otrzymywanych na podstawie wniosków o płatność, potrącane ze środków przekazanych od Instytucji Zarządzającej. Płatności te stanowiły dla spółki przychód zwolniony od opodatkowania CIT ze względu na art. 17 ust. 1 pkt 52 ustawy z 15.02.1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (Dz.U. z 2020 r. poz. 1406 z późn. zm.) zgodnie z którym wolne od podatku są "płatności na realizację projektów w ramach programów finansowanych z udziałem środków europejskich, otrzymane z Banku Gospodarstwa Krajowego, z wyłączeniem płatności otrzymanych przez wykonawców". Były więc traktowane jako forma dofinansowania, a więc nie podlegały podatkowi VAT. Okres monitorowania zakończył się w 2020 roku. W tym czasie umowa powinna wygasnąć a spółka powinna zwrócić pozostałe środki do instytucji zarządzającej. Umowa została jednak wydłużona na kolejne 5 lat poprzez zawarcie aneksu, na mocy którego spółka nie jest już uprawiona do udzielania jakichkolwiek nowych pożyczek, a jedynie posiada uprawnienia w zakresie monitorowania spłat pożyczek, przyjmowania wpłat, prowadzenie działań windykacyjnych i egzekucyjnych. Za dokonywanie tych czynności spółce przysługuje wynagrodzenie ryczałtowe w wysokości stałej comiesięcznej kwoty jako pokrycie kosztów. Owa opłata za zarządzanie posiada więc to samo przeznaczenie co refundacje kosztów otrzymywane w okresie monitorowania, jednak ma inny wymiar techniczny (stała kwota) oraz inną podstawę (aneks do umowy).

Czy spółka po podpisaniu aneksu może kwalifikować otrzymywane opłaty za zarządzanie tak jak refundacje kosztów otrzymywane w okresie monitorowania (tj. niepodlegające VAT)?