Czy słuszny jest pogląd zarysowany w orzecznictwie, iż wobec zrealizowanego budynku nie można wydać decyzji pozwolenia na budowę?

Przedmiotem pozwolenia na budowę była budowa budynku schroniska dla zwierząt. Organ I instancji umorzył postępowanie, z uwagi na rozpoczęcie robót budowlanych przed zakończeniem postępowania. Po rozpatrzeniu odwołania inwestora organ II instancji udzielił inwestorowi pozwolenia na budowę. Od decyzji tej strona postępowania wniosła skargę do WSA. W międzyczasie obiekt powstał i został przekazany do użytkowania. Wyrokiem WSA uchylono zarówno decyzję organ I i II instancji.

Jak w zaistniałem sytuacji winien postąpić organ I instancji rozpatrując sprawę?

Czy słuszny jest pogląd zarysowany w orzecznictwie, iż wobec zrealizowanego budynku nie można wydać decyzji pozwolenia na budowę?

Który organ i w jaki sposób winien załatwić sprawę?