Czy przysługuje prawo do odliczenia VAT z faktury ujemnej?

Spółka otrzymuje od operatora firmy "El..." spółki z o.o. o wyznaczonym profilu działalności oddział w Polsce fakturę VAT tytułem "prowizja za usługi akceptacji i rozliczania transakcji dokonanych za pomocą kart płatniczych w punkcie. Firma ta nalicza spółce miesięcznie określoną prowizje za obsługę kart płatniczych. Zgodnie z zapisem umowy firma udziela spółce rabatu od usług realizowanych za pośrednictwem DCC (DCC to usługa, która w momencie dokonania transakcji daje zagranicznym klientom - posiadaczom kart Visa lub Mastercard - możliwość płatności w ich rodzimej walucie). Im więcej takich transakcji spółka przeprowadzi tym większy osiąga zysk, tzn. gdy spółka zachęci klienta do skorzystania z DCC to El... udziela Spółce rabat. Prowizja pomniejszana jest zatem o rabat. Prowizja fakturowana jest ze stawką ZW (na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 40 ustawy o VAT). Spółka ma w tym zakresie następujący problem: 1. często prowizja jest znacznie mniejsza niż uzyskany rabat, lub 2. prowizja w danym miesiącu wynosi np. zero złotych a rabat np. 100 złotych. W obu przypadkach Spółka otrzymuje faktury ujemne. Często jest tak że jest np. faktura na 100 zł, a później rabat na 150 zł wówczas przychodzi korekta faktury, gdzie kwota po korekcie wynosi minus 50 zł.

Czy takie faktury ujemne są prawidłowe z punktu widzenia ustawy o VAT, często bowiem wypracowany rabat znosi prowizję do zera lub jest większy niż sama prowizja?