Czy prawie 2 lata po zakończeniu kontroli podatkowej organ podatkowy (w 2016 r.) może przeprowadzić postępowanie w PIT za 2009 r.?

Podatnik zakończył działalność gospodarczą (transport drogowy towarów) 31 grudnia 2009 r. Po rozliczeniu roku podatkowego podatnik odebrał z biura rachunkowego wszystkie dokumenty firmowe i złożył je w lokalu (warsztacie samochodowym) firmy, z którą uprzednio współpracował. W dniu 15 lutego 2013 r. w wyniku niesprawnego przewodu kominowego w ww. lokalu wybuchł pożar (zaświadczenie z pożaru wystawione przez Komendę Straży Pożarnej). W dniu 29 lipca 2014 r. rozpoczęła się kontrola podatkowa (zakres kontroli: kontrola właściwa podatku dochodowego od osób fizycznych za okres od 01-01-2009 do 31-12-2009), która trwała do 28 listopada 2014 r. Ponieważ w wyniku pożaru cała dokumentacja spłonęła, część odtworzono (wyciągi bankowe, faktury sprzedaży, faktury dotyczące leasingów, brak faktur dokumentujących sprzedaż środków trwałych, zakupu paliw). Jednak PKPiR nie odtworzono. W dniu 28 listopada 2014 r. został podpisany protokół z kontroli podatkowej. Ocena prawna: - brak dokumentacji źródłowej za okres I-XII 2009 r. (naruszenie przepisu art. 86 § 1 Ordynacji podatkowej, - nieprzedłożenie do kontroli pełnej dokumentacji źródłowej za okres od I-XII 2009 r. uniemożliwia dokonania na etapie niniejszej kontroli oceny prawnej w zakresie zaewidencjonowania przychodu i kosztów uzyskania przychodu. Podatnik zgodził się w całości z treścią protokołu. Komisarz skarbowy, dokonujący kontroli powiedział, że sprawę przekazuje do dalszego postępowania podatkowego. Od tamtego czasu nic się nie zadziało.

Czy można sprawę uznać jako zakończoną?