Czy organ podatkowy może skrócić termin płatności wynikającej z faktury i uznania, że należy zastosować termin ustawowy?

Zakład budowlany buduje domy wielorodzinne (mały przedsiębiorca). Podwykonawcami są różne firmy budowlane, między innymi firma brata i firma ojca (mikro przedsiębiorcy). Terminy płatności na fakturach zakupowych za wykonanie usług od innych kontrahentów są ustalone maksymalnie na 1 miesiąc, a od rodziny na 1 rok.

Czy takie działanie może zostać podważone przez urząd skarbowy i czy może spowodować to skrócenie terminu płatności do ustawowego, a co za tym idzie w przypadku braku zapłaty wyksięgowania z VAT 90 dni po ustawowym terminie płatności?