Czy nieodliczony VAT od naprawy samochodu może być kosztem uzyskania przychodów podatnika?

Osoba fizyczna prowadząca działalność gospodarczą ma wprowadzony do ewidencji środków trwałych samochód osobowy (nie zgłaszała go na VAT-26, nie prowadzi ewidencji przebiegu pojazdu). W kwietniu 2014 miała wypadek. Ubezpieczyciel pokrył koszty naprawy pojazdu i wynajmu samochodu zastępczego. Podatnik był zobowiązany do zapłaty kwot VAT z faktur dokumentujących naprawę i wynajem.

Czy w związku z tym, że ma prawo do odliczenia jedynie 50% VAT, drugie 50% zapłaconego VAT może być kosztem uzyskania przychodów?