Czy kompensata zaliczki z inną transakcją może być podstawą do wystawienia faktury korygującej zaliczkę?

Spółka otrzymała zaliczkę na dostawę określonego towaru. Po upływie 3 miesięcy kontrahent, który wpłacił zaliczkę zmienił warunki transakcji (towar i cenę). Dostawy dokonano na nowych warunkach, w takiej sytuacji spółka wystawiła korektę faktury zaliczkowej i kwotę zaliczki skompensowała (dokonała kompensaty) z należnością wynikająca z faktury sprzedaży.

Czy stanowisko spółki jest prawidłowe i czy kompensata zaliczki z inną transakcją może być podstawą do wystawienia faktury korygującej zaliczkę?