Czy dla usługi transportu towarów można przyjąć osobne zasady opodatkowania, niż dla samej ich dostawy?

W miesiącu wrzesień spółka dokonała sprzedaży wyrobów gotowych oraz ich transportu dla kontrahenta zagranicznego z NIP polskim. Zostały wystawione dwie faktury, w których wykazano stawkę 23%.

Czy spółka postąpiła prawidłowo?

Obecnie kontrahent ze Słowacji żąda od nas wystawienia faktur korygującej do usługi transportowej. Powołuje się na dyrektywę Rady UE nr 282/2011.

Czy powinniśmy zastosować odwrotne obciążenie, wystawiając faktury z numerem VAT SK, wykazując świadczenie usług poza terytorium kraju oraz dokonać korekty VAT-7 oraz informacji podsumowującej za m-c 09/2019, natomiast fakturę korygującą wykazać na bieżąco w momencie odbioru, czy jednak tutaj nie ma zastosowania art. 29a ustawy z 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. z 2018 r. poz. 2174), jeśli podstawę opodatkowania stanowi sprzedaż towarów dla której zastosowano stawkę 23% wraz usługą transportową?

W jaki sposób podatnik powinien opodatkować powyższe transakcje i wykazać w deklaracji?