Czy brak faktury uniemożliwia rozpoznanie kosztu uzyskania przychodu?

Polska spółka z o.o., czynny podatnik VAT,zlecił wykonanie doraźnej naprawy ciągnika siodłowego osobie fizycznej, której z góry zapłacił za wykonaną usługę. Osoba ta, pomimo złożonej obietnicy przez kilka miesięcy nie wystawiła obiecanej faktury, ani żadnego innego rachunku potwierdzającego wykonanie usługi, która faktycznie została wykonana. Przecież nawet osoba nieprowadząca ,,oficjalnej" działalności taki rachunek może wystawić. Spółka z o.o po sprawdzeniu, że domniemana osoba fizyczna nie figuruje w żadnych rejestrach osób prowadzących działalność gospodarczą oraz w rejestrze podatników VAT skierowała do urzędu skarbowego właściwego dla osoby fizycznej zawiadomienie o braku wystawienia przez nią dokumentu potwierdzającego wykonanie usługi. Urząd skarbowy w przesłanym piśmie do spółki z o.o potwierdził, że w sprawie braku wystawienia dokumentu potwierdzającego wykonanie usługi przez osobę fizyczną wszczął postępowanie wyjaśniające jednocześnie powiadamiając spółkę że z uwagi na RODO więcej żadnych informacji spółka tej sprawie nie otrzyma.

Czy w takiej sytuacji poniesione wydatek nieudokumentowany żadnym dokumentem (fakturą ,rachunkiem) spółka może zaliczyć w koszty uzyskania przychodów?

Z uwagi na fakt iż wykonanie takiej usługi podlega VAT, moim zdaniem spółka nie może sporządzić dowodu zastępczego, który by mógł stanowić podstawę do ujęcia w koszty wraz z postanowieniem z urzędu skarbowego oraz innymi dokumentami, które spółka posiada w swojej dokumentacji.