Jak ustalać kwotę pozwalającą na niepobieranie zaliczek?

Pracownik składa wniosek o niepobieranie zaliczki na podatek zgodnie z art. 31c PIT. W czerwcu 2023 r. pracownik osiąga przychód 9480 zł. W tym miesiącu nie ma pobranej zaliczki na podatek. Prawidłowe zachowanie systemu. W lipcu 2023 r. pracownik otrzymuje przychód w wysokości 25.000 zł. System liczy dochód, powyżej którego należy już liczyć zaliczkę: suma przychodów z dwóch miesięcy (34.480 zł) minus koszty (500 zł) =33 980 zł - kwota zwolnienia 3980 zł. Od kwoty 3980 zł nalicza zaliczkę na podatek. Nie budziłoby by to wątpliwości gdyby nie fakt, ze już w miesiącu powstania nadwyżki dochód powinien być jeszcze pomniejszony o składki społeczne, czyli od kwoty 3980 zł powinny być odjęte składki społeczne i na tej podstawie wyliczona zaliczka na podatek. Proszę o analizę tego przypadku.

Dlaczego dla zwolnienia art. 31c PIT stosuję kalkulację: przychód minus koszty?

Taką interpretację znalazłam na stronie MF z grudnia 2022 r.